Ιδρυματικό Αποθετήριο
Πολυτεχνείο Κρήτης
Πολυτεχνείο Κρήτης
EN
|
EL
| URI | http://purl.tuc.gr/dl/dias/DDDEE994-89C8-4157-9643-8F7260BF8ADE | - |
| Αναγνωριστικό | https://doi.org/10.1109/FPL.2009.5272367 | - |
| Αναγνωριστικό | https://doi.org/http://ieeexplore.ieee.org/document/5272367/ | - |
| Γλώσσα | en | - |
| Μέγεθος | 4 pages | en |
| Τίτλος | A FPGA based coprocessor for gene finding using Interpolated Markov Model (IMM) | en |
| Δημιουργός | Papaefstathiou Ioannis | en |
| Δημιουργός | Παπαευσταθιου Ιωαννης | el |
| Δημιουργός | Dollas Apostolos | en |
| Δημιουργός | Δολλας Αποστολος | el |
| Δημιουργός | Chrysos Grigorios | en |
| Δημιουργός | Χρυσος Γρηγοριος | el |
| Δημιουργός | Sotiriadis Evripidis | en |
| Δημιουργός | Σωτηριαδης Ευριπιδης | el |
| Εκδότης | Institute of Electrical and Electronics Engineers | en |
| Περίληψη | An important biology problem is the decoding of the DNA and the extraction of useful genetic information. There are many bioinformatics algorithms that try to solve the gene finding problem and one of the most efficient is the Glimmer algorithm. In this paper, we present a hardware architecture that implements the Glimmer algorithm. The architecture was developed specifically for the capabilities of present-day FPGAs. In addition, this paper presents an efficient hardware method to construct a huge but very sparse lookup table by taking advantage the tree-like structure of memories. | en |
| Τύπος | Πλήρης Δημοσίευση σε Συνέδριο | el |
| Τύπος | Conference Full Paper | en |
| Άδεια Χρήσης | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | en |
| Ημερομηνία | 2015-11-15 | - |
| Ημερομηνία Δημοσίευσης | 2009 | - |
| Θεματική Κατηγορία | FPGA | en |
| Θεματική Κατηγορία | IMM | en |
| Θεματική Κατηγορία | Interpolated Markov Model | en |
| Βιβλιογραφική Αναφορά | E. Sotiriades, I. Papaefstathiou, A. Dollas, G. Chrysos, "A FPGA based coprocessor for gene finding using Interpolated Markov Model (IMM)," in International Conference on Field Programmable Logic and Applications, 2009, pp. 683 - 686. doi: 10.1109/FPL.2009.5272367 | en |
Copyright © DIAS 2013
