Ιδρυματικό Αποθετήριο
Πολυτεχνείο Κρήτης
Πολυτεχνείο Κρήτης
EN
|
EL
| URI | http://purl.tuc.gr/dl/dias/5A92440D-9EC6-424D-8C28-7D9A1894513E | - |
| Αναγνωριστικό | https://doi.org/10.1109/IPDPS.2006.1639532 | - |
| Αναγνωριστικό | http://ieeexplore.ieee.org/document/1639532/ | - |
| Γλώσσα | en | - |
| Τίτλος | Some initial results on hardware BLAST acceleration with a reconfigurable architecture | en |
| Δημιουργός | Sotiriadis Evripidis | en |
| Δημιουργός | Σωτηριαδης Ευριπιδης | el |
| Δημιουργός | Kozanitis Christos | en |
| Δημιουργός | Dollas Apostolos | en |
| Δημιουργός | Δολλας Αποστολος | el |
| Εκδότης | Institute of Electrical and Electronics Engineers | en |
| Περίληψη | The BLAST algorithm is the prevalent tool that is used by molecular biologists for DNA sequence matching and database search. In this work we demonstrate that with an appropriate reconfigurable architecture, BLAST performance can be improved with a single-chip solution 5 times over a specialized and optimized computer cluster, or 37 times over a single computer. These initial results account for I/O and are very encouraging for the development of a large scale, reconfigurable BLAST engine. | en |
| Τύπος | Δημοσίευση σε Συνέδριο | el |
| Τύπος | Conference Publication | en |
| Άδεια Χρήσης | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | en |
| Ημερομηνία | 2015-11-17 | - |
| Ημερομηνία Δημοσίευσης | 2006 | - |
| Θεματική Κατηγορία | Informatics | en |
| Θεματική Κατηγορία | computer science | en |
| Θεματική Κατηγορία | informatics | en |
| Βιβλιογραφική Αναφορά | E. Sotiriades, C. Kozanitis and A. Dollas, "Some initial results on hardware BLAST acceleration with a reconfigurable architecture," in 20th International Parallel and Distributed Processing Symposium, 2006. doi: 10.1109/IPDPS.2006.1639532 | en |
Copyright © DIAS 2013
